HCP(human connectome project)数据集解读2

3.目录

MNINonLinear

fsaverage_LR59k

ROIS

T1w_restore.1.60.nii.gz

T2w_restore.1.60.nii.gz

release-notes

T1w

总结


个人数据集下载步骤:

1. 因为数据集比较大,所以要先下载Aspera插件才能进行下载(安装Aspera插件若非美国用户要把美式英语添加到语言列表),如果是要用大量数据集进行训练,可以直接在云端访问: 数据集已经上传在Amazon Simple Storage Service (S3) bucket中。

2. 设置好Aspera的下载位置之后登录ConnectomeDB,

选择感兴趣的数据集,例如1200这个数据集,点击右上角:

就可以选择类别,例如选择的是3TMRI数据集:

之后加入下载队列即可下载。

本文下载的是7TMRI的结构化处理数据集,但是得到的文件还是3TMRI的(可能是官方的问题吧)

解压文件夹之后有两类文件,一类是压缩包,命名规则是“编号 + _3T_Structural_1.6mm_preproc.zip”,代表不同被试者的高分辨率预处理包,

字段 含义
SubjectID 被试编号(如 100610、102311)
3T 数据是在 3T 磁共振设备上采集的(不是 7T)
Structural 结构像(T1w、T2w)
1.6mm 空间分辨率为 1.6 mm 各向同性
preproc 已完成 HCP 标准预处理(去噪、偏差场校正、颅骨剥离、配准等)

另一类是md5文件,用来验证下载的完整性,

例:在终端输入:md5sum -c 995174_3T_Structural_1.6mm_preproc.zip.md5,输出ok表示文件完整。

解压其中一个压缩包,得到:

一共有三个包,分别是原始空间的加权结构像和配准到标准空间后的结构像,以及说明文件。

名称 作用
T1w/ 被试 995174 的 原始空间 T1 加权结构像(已做颅骨剥离、偏差场校
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THE END
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