设置医疗机构批准书由谁发？

答: 医疗机构批准书由国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市的卫生健康委员会批准发放。
缘由：根据中华人民共和国《医疗机构管理条例》规定，医疗机构的执业资格需要经过国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市的卫生健康委员会的批准。
在批准前需要申请并提交相关材料，申请获批后方可颁发批准书。
医疗机构批准书是医疗机构从事执业活动的重大凭证，具有法律效力，确保医疗机构在合法合规的前提下为人民群众提供优质的医疗服务。